Marie DAUBRESSE-CHASLE : Reconstruction de la déformation d'une scène tubulaire en vue de l'utilisation d'une meute de capsules miniaturisées dans l'intestin grêle

Résumé: L'intestin grêle est un organe complexe à observer de l'intérieur du fait de sa longueur et sa tortuosité. Pourtant cela reste nécessaire dans le cadre du diagnostic et du suivi de certaines maladies telles que la maladie de Crohn ou les polyposes. Si les capsules endoscopiques permettent depuis plus de vingt ans de parcourir l'intégralité de l'intestin grêle, son déplacement passif soumis au péristaltisme et sa faible fréquence d'acquisition d'image rendent l'analyse chronophage et fastidieuse. La reconstruction 3D de l'intestin grêle à partir des vidéos est une piste envisagée pour faciliter l'analyse et localiser les lésions. Cette reconstruction n'est pas aisée du fait des facteurs environnementaux : la déformation de l'intestin, sa forme tubulaire et sa texture uniforme, mais aussi techniques avec des images de faible résolution et un mouvement et une vitesse de la capsule
non contrôlés. Après l'analyse du besoin clinique, nous introduisons le concept de meute de capsules endoscopiques miniatures. L'utilisation d'une telle meute pourra rendre possible l'observation de l'intestin chez les patients atteints de sténoses, c'est- à-dire un rétrécissement de la lumière intestinale suite à l'inflammation des tissus. Elle évitera aussi certains examens préliminaires à l'utilisation des capsules actuelles pour ces patients et pourra être utilisée plus largement chez les enfants. Dans ce contexte, nous proposons une modification des procédures de diagnostic et de suivi de la maladie de Crohn. Cependant, la réduction de la qualité de l'image de ces mini-capsules, par la diminution de la résolution et le manque de lumière, impactera non seulement la visibilité des lésions, mais aussi les algorithmes de reconstruction. De ce fait, nous réfléchissons aux différentes stratégies de reconstruction déformable et multivue de l'intestin grêle. Nous posons ainsi les bases d'un algorithme de reconstruction et localisation simultanés pour l'intestin, le GutSLAM.[...]

Composition du jury :

M. Nicolas ANDREFF Professeur des universités Université Bourgogne Franche-Comté Directeur de thèse
M. Aymeric HISTACE Professeur ENSEA Rapporteur
M. Désiré SIDIBE Professeur des universités Université d'Evry - Paris Saclay Rapporteur
Mme Shaifali PARASHAR Chargée de recherche INSA Lyon Co-encadrante de thèse
Mme Céline FOUARD Maîtresse de conférences Université Grenoble Alpes Examinatrice
M. Cédric DEMONCEAUX Professeur des universités Université Bourgogne Franche-Comté Examinateur

Localisation : SUPMICROTECH ENSMM 26, rue de l’Épitaphe 25000 BESANCON Salle : Amphithéâtre Jules Haag