Serge MOULIN " Apport de techniques d'analyse de données pour résoudre des problèmes spécifiques en bio-informatique"

Travaux de thèse de Serge Moulin : Apport de techniques d'analyse de données pour résoudre des problèmes spécifiques en bio-informatique"

Résumé : De nos jours, la quantité de données génétiques séquencées augmente de manière exponentielle sous l'impulsion d'outils de séquençage de plus en plus performants, tels que les outils de séquençage haut débit en particulier. De plus, ces données sont de plus en plus facilement accessibles grâce aux bases de données en ligne. Cette plus grande disponibilité des données ouvre de nouveaux sujets d'étude qui nécessitent de la part des statisticiens et bio-informaticiens de développer des outils adaptés. Par ailleurs, les progrès constants de la statistique, dans des domaines tels que le clustering, la réduction de dimension, ou les régressions entre autres, nécessitent d'être régulièrement adaptés au contexte de la bio-informatique. L’objectif de cette thèse est l’application de techniques avancées de statistiques à des problématiques de bio-informatique. Dans ce manuscrit, nous présentons les résultats de nos travaux concernant le clustering de séquences génétiques via Laplacian eigenmaps et modèle de mélange gaussien, l'étude de la propagation des éléments transposables dans le génome via un processus de branchement, l'analyse de données métagénomiques en écologie via des courbes ROC ou encore la régression polytomique ordonnée pénalisée par la norme l1.

Jury de thèse : 

Christophe GUYEUX directeur de thèse

Stephane CHRETIEN co-directeur de thèse

Julien JACQUES rapporteur

Arnaud LE ROUZIC rapporteur

Localisation : Amphithéâtre 4 - IUT Belfort-Montbéliard - 19, Avenue du Maréchal Juin 90016 BELFORT