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Stage M2 : Bioingénierie/Bioproduction – Expression de la protéine HDA

Dans le cadre d’une collaboration avec l’équipe FEMTO-ST équipe BIND (Besançon) et l’INRAE de Dijon (AAP HARMI 2025), nous proposons un sujet de stage de Master 2 au sein de l’équipe BIND. Nous travaillons avec la bactérie Lactococcus lactis et nos travaux portent sur la production, isolement et caractérisations de protéines produites par cette bactérie après induction par la nisine.

Nous proposons un stage de Master 2 au sein de notre équipe qui débutera en janvier 2026. Le sujet porte sur l’expression hétérologue d’une protéine de plante, HDA, dans la bactérie Lactococcus lactis. Ce stage comportera plusieurs étapes avec le clonage du gène codant pour la protéine en absence ou présence d’étiquettes d’affinité puis la production par induction à la nisine de la protéine dans la bactérie et d’effectuer des caractérisations biochimiques des protéines produites. La protéine sera ensuite purifiée et son activité sera testée par l’équipe de l’INRAE de Dijon.

 

Contact: 

annie.frelet-barrand@femto-st.fr

+ d'infos :
Icône PDF stagiaire_m2_bind-inrae.pdf
https://www.femto-st.fr/fr/offres-emploi-stage-these/stages#job-5833

Stage M2 : Bioingénierie/Bioproduction – Expression de protéines de signalisation

Dans le cadre d’une collaboration avec l’équipe FEMTO-ST équipe BIND et le CTM de Dijon (AAP EIPHI 2024), nous proposons un sujet de stage de Master 2 au sein de l’équipe BIND. Nous travaillons avec la bactérie Lactococcus lactis et nos travaux portent sur la production, isolement et caractérisations de protéines produites par cette bactérie après induction par la nisine.

Nous proposons un stage de Master 2 au sein de notre équipe. Le sujet porte sur l’expression hétérologue de protéines de signalisation impliquées notamment dans la fibrose pulmonaire idiopathique dans la bactérie Lactococcus lactis. Ce stage comportera plusieurs étapes avec le clonage du gène codant pour la protéine en absence ou présence d’étiquettes d’affinité puis la production par induction à la nisine de protéines dans la bactérie et enfin, d’effectuer des caractérisations biochimiques des protéines produites. Les protéines seront ensuite purifiées et leurs activités seront testées par l’équipe mais aussi par l’équipe du CTM de Dijon.

Contact: 

annie.frelet-barrand@femto-st.fr

+ d'infos :
Icône PDF stagiaire_m2_bind.pdf
https://www.femto-st.fr/fr/offres-emploi-stage-these/stages#job-5832

AS2M: Stage Développement d’une librairie Python open-source d’interfaçage avec un contrôleur LabVIEW CompactRIO, pour un dispositif de recherche en neurosciences

L'équipe DATA-PHM du Département d’AS2M propose un stage de recherche de type M1/M2 Recherche / Ecole d’ingénieur.e.s à l’intersection entre l’instrumentation, les objects connectés et les neurosciences/sciences de la parole.

Le stage sera basé à l’Institut FEMTO-ST à Besançon et sera supervisé par Patrick Nectoux (Ingénieur de recherche CNRS) et Jean-Julien Aucouturier (Directeur de recherche CNRS en informatique).

Le stage sera conventionné et indemnisé par SUPMICROTECH/ENSMM (environ 570€ mensuel, selon le volume horaire).

But du stage : Le but du stage est de développer les couches Python et LabVIEW permettant une communication entre un PC et le dispositif CompactRIO via un protocole à déterminer (typiquement, port série sur connectique USB ou RS-232). Côté Python, le but est de développer une librairie avec une API permettant de passer et recevoir plusieurs types de messages (a minima, se connecter au device, lui envoyer des changements de paramètres). La librairie sera diffusée de façon open-source sur le github de l’équipe et documentée sous le framework Materials for Mkdown (ex. https://neuro-team-femto.github.io/cleese/). Côté LabVIEW, le but est de développer une couche logicielle I/O au sein du code LabVIEW existant, et qui soit capable de recevoir, parser et interpréter ces messages, ainsi que d’envoyer des informations vers Python en retour.

Dates du stage : Printemps-été 2025 (Mars - Août 2025)

Candidature : Envoyer les élements suivants

1 - un CV,
2 - une lettre de motivation (détaillant obligatoirement vos expériences de conception de systèmes communiquants, en programmation Python et en programmation LabVIEW),
3 - le nom et le contact de 1 référent académique (professeur, tuteur de stage, etc.) à même de vous recommander (pas besoin de lettre de recommandation au moment de la candidature)

Contact: 

jean.aucouturier@femto-st.fr   et patrick.nectoux@femto-st.fr

+ d'infos :
https://neuro-team-femto.github.io/2024/09/19/M2_internship_io.html
https://www.femto-st.fr/fr/offres-emploi-stage-these/stages#job-5575